Vaciar todas las tablas de una BDs:

1

Obten el nombre de todas tablas.

SET FOREIGN_KEY_CHECKS = 0;

SELECT CONCAT(table_name, ';')
FROM information_schema.tables
WHERE table_schema = 'nombre_de_tu_base';

SET FOREIGN_KEY_CHECKS = 1;
2

Con las tablas obtenidas; generar un comando similar a.

SET FOREIGN_KEY_CHECKS = 0;  -- Permite borrar en cualquier orden (OJO: úsalo con cuidado)

DELETE FROM Asignaciones;
DELETE FROM IDs;

SET FOREIGN_KEY_CHECKS = 1;

-- Reinicia contadores si lo necesitas

ALTER TABLE yussme_evaluar.Asignaciones AUTO_INCREMENT = 1;
ALTER TABLE yussme_evaluar.IDs AUTO_INCREMENT = 1;

Antes de ejecuar en phpMyAdmin desmarca la opción: Habilite la revisión de las claves foráneas